Algoritmi consolidati per la scoperta di biomarker

Qui riportiamo tre algoritmi ampiamente utilizzati e consolidati per la scoperta di biomarcatori. I dati devono essere acquisiti mediante spettrometria di massa in cromatografia liquida. Sono tutti open source e possono essere liberamente scaricati e utilizzati:

  • mzmine sulla piattaforma Java. L’estrazione dei dati può essere fortemente personalizzata.
  • XCMS sulla piattaforma R. Estrae solo dati ad alta frequenza con un buon profilo cromatografico.
  • apLCMS sulla piattaforma R. Estrae tutti i segnali, anche quelli a bassa intensità.

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